El primer reto es la construcción de una estrategia de modelación que permita, al mismo tiempo, captar los efectos de las interacciones entre la población civil, las organizaciones armadas y el Estado, en un contexto de interacción estratégica y territorial. Como sabemos que la disputa territorial de los agentes armados ha cambiado la organización regional del país, queremos encontrar los métodos teóricos y estadísticos que nos permitan ir, desde la coordinación de acciones individuales, hasta el agregado de acciones de la población y de los agentes armados en juegos de interacción local. El punto es: ¿cómo llegar desde las interacciones locales a los agregados? El resultado sería una idea aproximada de la dinámica de la interacción entre las acciones de los agentes armados, los territorios y las poblaciones. Un segundo reto es ampliar, afinar y precisar el uso de la noción de racionalidad en la investigación en ciencias sociales. En el contexto brindado por la teoría de juegos queremos entender y predecir las acciones de agentes racionales en situaciones interactivas, ya sean de conflicto, de elección de teorías o de avance del conocimiento. El desafío es aprender a captar las percepciones, los procedimientos racionales y las decisiones de los agentes en situaciones diversas y con distintas estructuras de información. Un tercer reto es modelar las conjeturas y comportamiento de la población civil en redes sociales espontáneas, en un contexto de interacción estratégica con grupos armados. La introducción de métodos de experimentales es un desarrollo natural de los dos retos anteriores. Por último, la integración de estos retos particulares debe conducir a la construcción de una teoría de la guerra irregular y de su duración.